En el sistema nervioso de los reptiles destacan los dos grandes lóbulos olfatorios que se encuentran ubicados en el encéfalo, los cuales se comunican con los hemisferios cerebrales. Los lóbulos ópticos se encuentran situados en la parte posterior. Poseen un cerebelo y una médula oblonga que se expansiona de forma lateral para formar luego el cordón nervioso espinal, así como doce pares de nervios craneales y un par de nervios espinales. También disponen de papilas gustativas, células olfatorias y glándulas lagrimales. El oído es similar al del resto de los vertebrados terrestres.
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